RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592863.2

POLRMT-208, Transcript of RNA polymerase mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene POLRMT, Length 966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L11C9JVI0 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L18D6R9N7 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L22D6RA61 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L19D6RCP7 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L20D6RJB6 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP14P54578 494 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 CCNA1P78396 465 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP17L24Q0WX57 530 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 WDR78Q5VTH9 848 aa24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 CCL14Q16627 93 aa24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 MORN1Q5T089 497 aa24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 USP6NLQ92738 828 aa24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 CABP5Q9NP86 173 aa24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.15■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 MYH8P13535 1937 aa24.14■■□□□ 1.46
POLRMT-208ENST00000592863 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SYN1P17600 705 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 VCAM1P19320 739 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 LRCH3Q96II8 777 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.14■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 PFASO15067 1338 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MAP2K5Q13163 448 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 ACER1Q8TDN7 264 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 PANK1Q8TE04 598 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 GDF15Q99988 308 aa24.13■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 CNMDO75829 334 aa24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SHMT1P34896 483 aa24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 PLCD1P51178 756 aa24.11■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.11■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 APBB1O00213 710 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 PDE6AP16499 860 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 BMP8BP34820 402 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 BCL11AQ9H165 835 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.1■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SEPT2Q15019 361 aa24.09■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.09■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 LHX8Q68G74 356 aa24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 LBX2Q6XYB7 198 aa24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 BTBD7Q9P203 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
POLRMT-208ENST00000592863 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.08■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 GOLIM4O00461 696 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 COL6A1P12109 1028 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 PTPREP23469 700 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 GUCY1A2P33402 732 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.07■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 ATP2B2Q01814 1243 aa24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 EVX2Q03828 476 aa24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 GABPAQ06546 454 aa24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 GRB14Q14449 540 aa24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 CNGA1P29973 690 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 TDHQ8IZJ6 230 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 LCORLQ8N3X6 602 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.05■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 HMMRO75330 724 aa24.04■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 MIER1Q8N108 512 aa24.04■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 MYH7P12883 1935 aa24.04■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 HOXC6P09630 235 aa24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 CYP2D6P10635 497 aa24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 MS4A1P11836 297 aa24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
POLRMT-208ENST00000592863 RLFQ13129 1914 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms