RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1B1P15121 316 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K10Q02779 954 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ATAD5Q96QE3 1844 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TROAPQ12815 778 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 RTN1Q16799 776 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCBQ8NB91 859 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 GLTPD2A6NH11 291 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP95Q96GE4 821 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 STX8Q9UNK0 236 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CTDNEP1O95476 244 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 HOOK2Q96ED9 719 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR4Q9NYA4 1195 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR90Q96KV7 1748 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPDC1A2A3K4 754 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TOP1P11387 765 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3GAP1Q15042 981 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA1Q8ND90 353 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL10Q9BUA6 226 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM179Q6ZVK1 233 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP133Q8WUM0 1156 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TEPSINQ96N21 525 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB129Q9H1M3 183 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM47Q9BQJ4 181 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL1O95922 423 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 RXRAP19793 462 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC27P30260 824 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM184AQ8NB25 1140 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 KANSL2Q9H9L4 492 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CABP5Q9NP86 173 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM196BA6NMK8 535 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 JAK2O60674 1132 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNAR1P17181 557 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF5BP33176 963 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ADD1P35611 737 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NTRK3Q16288 839 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCB5Q2M3G0 1257 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 UTRNP46939 3433 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS22Q8NE09 1264 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 GGA3Q9NZ52 723 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT1P21579 422 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 STK36Q9NRP7 1315 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 STX6O43752 255 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NYAP2Q9P242 653 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-206ENST00000588815 BRD1O95696 1058 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GINM1Q9NU53 330 aa36.12■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa36.12■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SLURP2P0DP57 97 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GNAQP50148 359 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF15Q66K64 600 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 MKL1Q969V6 931 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX11Q96FC9 970 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GRM4Q14833 912 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM22Q8IYM9 498 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CDAN1Q8IWY9 1227 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK1Q14185 1865 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHX2P34913 555 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 WASF1Q92558 559 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIP2Q9UDT6 1046 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GDF11O95390 407 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 FDPSP14324 419 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 PKP1Q13835 747 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 TMTC3Q6ZXV5 915 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 LZTS2Q9BRK4 669 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC9Q9Y397 364 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GH2P01242 217 aa36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CAP2P40123 477 aa36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ICA1Q05084 483 aa36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 MIGA2Q7L4E1 593 aa36.07■■■■□ 3.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCY1A2P33402 732 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT2Q15019 361 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF11Q86T75 865 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa36.05■■■■□ 3.36
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