RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 DEFB118Q96PH6 123 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 FEZ1Q99689 392 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 HAUS7Q99871 368 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L15C9J2P7 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L11C9JVI0 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L18D6R9N7 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L22D6RA61 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L19D6RCP7 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L20D6RJB6 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 MAPK4P31152 587 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP17L24Q0WX57 530 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 Q3C1V9 767 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ACER1Q8TDN7 264 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.133e-7■■■□□ 16.8
CTIF-206ENST00000588345 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 EVX2Q03828 476 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 DPF3Q92784 378 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 VCAM1P19320 739 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 UBE3CQ15386 1083 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 LBX2Q6XYB7 198 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 TRIB2Q92519 343 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP6NLQ92738 828 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 PORCNQ9H237 461 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ARMT1Q9H993 441 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 RPTORQ8N122 1335 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 TRIM32Q13049 653 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 SEPT2Q15019 361 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 BCL11AQ9H165 835 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 SWAP70Q9UH65 585 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 MYH8P13535 1937 aa22.08■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CNMDO75829 334 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 MBD4O95243 580 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CYP2D6P10635 497 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CYP2B6P20813 491 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 MORN1Q5T089 497 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 GPR142Q7Z601 462 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 PRKAB2O43741 272 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PRG0 241 aa22.05■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.05■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.05■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.05■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CHGBP05060 677 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 RGS2P41220 211 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CCNA1P78396 465 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 C12orf60Q5U649 245 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 DCTPP1Q9H773 170 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.04■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 APBA2Q99767 749 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 BTBD7Q9P203 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 RLFQ13129 1914 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 ALPK3Q96L96 1907 aa22.03■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 MAP2K5Q13163 448 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-206ENST00000588345 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 AKR1B1P15121 316 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 CCDC17Q96LX7 622 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 PRO3102Q9H379 93 aa22.01■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 SLC15A5A6NIM6 579 aa22■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 USP17L12C9JPN9 530 aa22■■□□□ 1.11
CTIF-206ENST00000588345 USP17L21D6R901 530 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms