RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 NOVP48745 357 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF186Q9NXI6 227 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIM75PA6NK02 468 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 C19orf81C9J6K1 198 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 BTBD19C9JJ37 291 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 USP17L10C9JJH3 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 CASC1Q6TDU7 716 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 RLFQ13129 1914 aa22.18■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 A0A1W2PRG0 241 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF213O14771 459 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 PRDM1O75626 825 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 HAND2P61296 217 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 MTMR2Q13614 643 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.17■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 NEDD4P46934 1319 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 CYP21A2P08686 494 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ICA1Q05084 483 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ACER1Q8TDN7 264 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 NYAP2Q9P242 653 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 TMX2Q9Y320 296 aa22.16■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 FOXN1O15353 648 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 HMGCS2P54868 508 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 INCENPQ9NQS7 918 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDGFL2-201ENST00000587016 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 USP14P54578 494 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 NECTIN1Q15223 517 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.14■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TFAP4Q01664 338 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 MKL1Q969V6 931 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 CEP95Q96GE4 821 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.13■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TRPA1O75762 1119 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY3P0CV98 308 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY8P0CW00 308 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 DGKZQ13574 1117 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TREML2Q5T2D2 321 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 SH2D4AQ9H788 454 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.12■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TSPY2A6NKD2 308 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 PDHXO00330 501 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 LPAR1Q92633 364 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 FEZ1Q99689 392 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 VCPKMTQ9H867 229 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.11■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 VCAM1P19320 739 aa22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 CRHR2Q13324 411 aa22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 ESR2Q92731 530 aa22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.1■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TTLL1O95922 423 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 KCNB2Q92953 911 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 KRT23Q9C075 422 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.09■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC27A2O14975 620 aa22.08■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 TLR2O60603 784 aa22.08■■□□□ 1.13
HDGFL2-201ENST00000587016 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.135e-8■■□□□ 13.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms