RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L15C9J2P7 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L11C9JVI0 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L18D6R9N7 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L22D6RA61 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L19D6RCP7 530 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L20D6RJB6 530 aa29.01■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L24Q0WX57 530 aa29.01■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP17L21D6R901 530 aa29■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.99■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.99■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ERVK-24P63145 666 aa28.97■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 Q3C1V9 767 aa28.96■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SBK1Q52WX2 424 aa28.93■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.93■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.93■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMX2Q9Y320 296 aa28.91■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SGPL1O95470 568 aa28.9■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GNAT2P19087 354 aa28.9■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.9■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SH2D4AQ9H788 454 aa28.9■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLXNB2O15031 1838 aa28.9■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 M0R2C6 588 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCNA1P78396 465 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPR142Q7Z601 462 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.89■■■□□ 2.22
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LPAR1Q92633 364 aa28.89■■■□□ 2.22
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