RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RAD21	O60216	631 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	KDM4A	O75164	1064 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	HMGCS2	P54868	508 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	PPAT	Q06203	517 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	MTMR2	Q13614	643 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CCL15	Q16663	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	FEZ1	Q99689	392 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PRG0	241 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	FGR	P09769	529 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	NOG	Q13253	232 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8	3e-7	■■■■□ 20.8
RPL4-208	ENST00000564744	ABCB7	O75027	752 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CPA1	P15085	419 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	HSPA4	P34932	840 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	GTF2A2	P52657	109 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	TRDN	Q13061	729 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ESR2	Q92731	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	KRT23	Q9C075	422 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L10	C9JJH3	530 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	CETP	P11597	493 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	MCC	P23508	829 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	BACE1	P56817	501 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	ANTXR2	P58335	489 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	MOGS	Q13724	837 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	TREML2	Q5T2D2	321 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	PTPN18	Q99952	460 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	TNKS	O95271	1327 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	BTBD19	C9JJ37	291 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	CXCL11	O14625	94 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	PRC1	O43663	620 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	TTLL1	O95922	423 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPL4-208	ENST00000564744	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81

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