RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 PAX4O43316 350 aa6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 CRKP46108 304 aa6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.41□□□□□ -1.38
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GDE1-202ENST00000563645 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.41□□□□□ -1.38
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GDE1-202ENST00000563645 SPON2Q9BUD6 331 aa6.38□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 PAPLNO95428 1278 aa6.37□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 NKD1Q969G9 470 aa6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 ASIC4Q96FT7 647 aa6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 KIF2CQ99661 725 aa6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.36□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.36□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 ZNF165P49910 485 aa6.35□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.35□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.35□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.34□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 MCM4P33991 863 aa6.34□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 RGS22Q8NE09 1264 aa6.34□□□□□ -1.39
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GDE1-202ENST00000563645 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.34□□□□□ -1.39
GDE1-202ENST00000563645 LRRN2O75325 713 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 UBOX5O94941 541 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ESR1P03372 595 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TXKP42681 527 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 RNF4P78317 190 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 GAB4Q2WGN9 574 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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