RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 HTTP42858 3142 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 LAMA3Q16787 3333 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 XYLBO75191 536 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 EGFRP00533 1210 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 RAC1P63000 192 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GPLD1P80108 840 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 OLFM4Q6UX06 510 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 COL26A1Q96A83 441 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TJP1Q07157 1748 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf172C9J069 976 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ELNP15502 786 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NOGQ13253 232 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PERM1Q5SV97 790 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 EVC2Q86UK5 1308 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 H0YGN5 161 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SELPP16109 830 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NRLP54845 237 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FAM26DQ5JW98 314 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 BCORQ6W2J9 1755 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 COL4A5P29400 1685 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TNFRSF10BO14763 440 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D8O95759 1140 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PSAPP07602 524 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 HUNKP57058 714 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PLAURQ03405 335 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GRIK5Q16478 980 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 CSRNP1Q96S65 589 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 INSRP06213 1382 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 J3QW42 95 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FZD9O00144 591 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 MMP20O60882 483 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ADGRE1Q14246 886 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GPC2Q8N158 579 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TMC1Q8TDI8 760 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TTC9Q92623 222 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 EYSQ5T1H1 3165 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 GHRHP01286 108 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 MBTPS1Q14703 1052 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 STIM2Q9P246 746 aa6.34□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 PHKG2P15735 406 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-210ENST00000561408 ATP2B4P23634 1241 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-210ENST00000561408 ITGB7P26010 798 aa6.33□□□□□ -1.4
TMOD3-210ENST00000561408 SOX18P35713 384 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms