RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560589.5

TLE3-222, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-222	ENST00000560589	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	MTR	Q99707	1265 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	TAF5L	O75529	589 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ITGB4	P16144	1822 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	PDHB	P11177	359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	RPS6KA3	P51812	740 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	POLE2	P56282	527 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	DESI2	Q9BSY9	194 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	DHX58	Q96C10	678 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC151	A5D8V7	595 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	TXLNA	P40222	546 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CTSW	P56202	376 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	KCNB2	Q92953	911 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	GNPAT	O15228	680 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	NEFH	P12036	1026 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ME1	P48163	572 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	SLIT2	O94813	1529 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	NR1I2	O75469	434 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	ATP5J	P18859	108 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	XAGE2	Q96GT9	111 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE3-222	ENST00000560589	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	OAT	P04181	439 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SCNN1B	P51168	640 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SCARF1	Q14162	830 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	TTC6	Q86TZ1	520 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CAPN15	O75808	1086 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	BRD3	Q15059	726 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CAMTA2	O94983	1202 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CLTA	P09496	248 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	USP5	P45974	858 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CCZ1B	P86790	482 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	STX1A	Q16623	288 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	WASHC4	Q2M389	1173 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	PDE8A	O60658	829 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CTAGE8	P0CG41	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TLE3-222	ENST00000560589	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35

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