RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 HK2P52789 917 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 NFIXQ14938 502 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 RGS22Q8NE09 1264 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 USTQ9Y2C2 406 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM13O60858 407 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 CBX7O95931 251 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GSTT1P30711 240 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 NFKB2Q00653 900 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 DSC3Q14574 896 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 HID1Q8IV36 788 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 HDXQ7Z353 690 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TMC1Q8TDI8 760 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 BRD1O95696 1058 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF385BQ569K4 471 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 Q96M66 194 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 ADAMTS20P59510 1910 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 FITM1A5D6W6 292 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 KCNA1Q09470 495 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TMC7Q7Z402 723 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 KCTD3Q9Y597 815 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 WASH4PA8MWX3 477 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SNX17Q15036 470 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GGNQ86UU5 652 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 CREG2Q8IUH2 290 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 OXR1Q8N573 874 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 SHISA4Q96DD7 197 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.16□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 HRKO00198 91 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 GFRA2O00451 464 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TMOD3-202ENST00000558300 RFXAPO00287 272 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 GIPC1O14908 333 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 TREHO43280 583 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF605Q86T29 641 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CDH24Q86UP0 819 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 FBF1Q8TES7 1133 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.14□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO24O75426 580 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CELA3AP09093 270 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 GRK4P32298 578 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ETV3P41162 512 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SSPNQ14714 243 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.13□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CDK8P49336 464 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 BORCS6Q96GS4 357 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.12□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 ADRB1P08588 477 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 CHRNEQ04844 493 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 EGR3Q06889 387 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SLC6A19Q695T7 634 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.11□□□□□ -1.43
TMOD3-202ENST00000558300 SGPP1Q9BX95 441 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms