RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGRP09769 529 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BACE1P56817 501 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTMR2Q13614 643 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SEPT2Q15019 361 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C19orf81C9J6K1 198 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BTBD19C9JJ37 291 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF213O14771 459 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ORC4O43929 436 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPA1O75762 1119 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HMGCS2P54868 508 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HAND2P61296 217 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ICA1Q05084 483 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NBPF3Q9H094 633 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY3P0CV98 308 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY8P0CW00 308 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NT5C2P49902 561 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP14P54578 494 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTH1RQ03431 593 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FEZ1Q99689 392 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH2D4AQ9H788 454 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PARP14Q460N5 1801 aa15.28■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LBX1P52954 281 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACER1Q8TDN7 264 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP4K1Q92918 833 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C12orf42Q96LP6 360 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.27■□□□□ 0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.27■□□□□ 0.04
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TFAP4Q01664 338 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CRHR2Q13324 411 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 INCENPQ9NQS7 918 aa15.26■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NEDD4P46934 1319 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRG0 241 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY2A6NKD2 308 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DGKZQ13574 1117 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TREML2Q5T2D2 321 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOMM22Q9NS69 142 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NYAP2Q9P242 653 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSKSQ9UJT2 592 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PNMA3Q9UL41 463 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMX2Q9Y320 296 aa15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RLFQ13129 1914 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D8O95759 1140 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYP21A2P08686 494 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LPAR1Q92633 364 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ESR2Q92731 530 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP95Q96GE4 821 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.24■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.23■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.23■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MGAMO43451 1857 aa15.23■□□□□ 0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTLL1O95922 423 aa15.23■□□□□ 0.03
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