RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPN18Q99952 460 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPY2A6NKD2 308 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP2B2Q01814 1243 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ICA1Q05084 483 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 MTMR2Q13614 643 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 MOGSQ13724 837 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A1W2PRG0 241 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 B4E1Z4 1266 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 E7EWF7 191 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 NMT2O60551 498 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 REC8O95072 547 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CETPP11597 493 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TM4SF4P48230 202 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 HMGCS2P54868 508 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 SREBF2Q12772 1141 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L10C9JJH3 530 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 BACE1P56817 501 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP95Q96GE4 821 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM4AO75164 1064 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 SEC24BO95487 1268 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 C8orf34Q49A92 452 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 JMYQ8N9B5 988 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 FEZ1Q99689 392 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 MYH4Q9Y623 1939 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 INHBEP58166 350 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 IFNL1Q8IU54 200 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 RASEFQ8IZ41 740 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 ESR2Q92731 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 USP26Q9BXU7 913 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 KRT23Q9C075 422 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 BTBD19C9JJ37 291 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TREML2Q5T2D2 321 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 C19orf81C9J6K1 198 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TRDNQ13061 729 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF20Q5VTR2 975 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 NYAP2Q9P242 653 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TMX2Q9Y320 296 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TTLL1O95922 423 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 HSPA4P34932 840 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 NCOA7Q8NI08 942 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 WBP1LQ9NX94 342 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF186Q9NXI6 227 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 STX8Q9UNK0 236 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-207ENST00000551594 TRPA1O75762 1119 aa22.15■■□□□ 1.14
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CTDSP2-207ENST00000551594 USP14P54578 494 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNB2Q92953 911 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 MKL1Q969V6 931 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 VCPKMTQ9H867 229 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NOVP48745 357 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.13■■□□□ 1.13
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