RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 ICA1Q05084 483 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 ACER1Q8TDN7 264 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 WDR18Q9BV38 432 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 MYH4Q9Y623 1939 aa20.35■□□□□ 0.85
BRF1-217ENST00000550375 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.35■□□□□ 0.85
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BRF1-217ENST00000550375 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.33■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.32■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 TM4SF4P48230 202 aa20.3■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 MOGSQ13724 837 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.3■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 NYAP2Q9P242 653 aa20.3■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 SH2D4AQ9H788 454 aa20.29■□□□□ 0.84
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BRF1-217ENST00000550375 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.28■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 NT5C2P49902 561 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BRF1-217ENST00000550375 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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