RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 PDE6AP16499 860 aa6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 CYP7A1P22680 504 aa6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 FLT3LGP49771 235 aa6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ANKRD49-208ENST00000544253 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 FDX1P10109 184 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 CYP2C8P10632 490 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 GNAT2P19087 354 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ERVK-9P63128 1117 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ERVK-24P63145 666 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PICALMQ13492 652 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MROH8Q9H579 483 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PLA2G6O60733 806 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SPP2Q13103 211 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SNX17Q15036 470 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PI16Q6UXB8 463 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 GUCY1A2P33402 732 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MAP2K5Q13163 448 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MTMR2Q13614 643 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 AACSQ86V21 672 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 GABRQQ9UN88 632 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TNNQ9UQP3 1299 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TMX2Q9Y320 296 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM75PA6NK02 468 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 H0YGN5 161 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC25A27O95847 323 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 NOVP48745 357 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 OAZ1P54368 228 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 HMGCS2P54868 508 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 RNF208Q9H0X6 261 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 DCTPP1Q9H773 170 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PTPREP23469 700 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 C12orf60Q5U649 245 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 CABP5Q9NP86 173 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 HTTP42858 3142 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 VCAM1P19320 739 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MTFR1Q15390 333 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 GPR142Q7Z601 462 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 MKL1Q969V6 931 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 GPATCH3Q96I76 525 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 PNMA2Q9UL42 364 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 USP5P45974 858 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 JAG1P78504 1218 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 DNM1LO00429 736 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD49-208ENST00000544253 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms