RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
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SUDS3-204ENST00000543473 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 ARID5BQ14865 1188 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC174Q6PII3 467 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 ARMT1Q9H993 441 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 MXRA7P84157 204 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 KIF2CQ99661 725 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.59■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SUDS3-204ENST00000543473 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 CEP83Q9Y592 693 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 CEP104O60308 925 aa21.58■■□□□ 1.05
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SUDS3-204ENST00000543473 VWA3BQ502W6 1294 aa21.58■■□□□ 1.05
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SUDS3-204ENST00000543473 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 TSKSQ9UJT2 592 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 ADCY9O60503 1353 aa21.58■■□□□ 1.05
SUDS3-204ENST00000543473 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.58■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R7Q15435 360 aa21.57■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.57■■□□□ 1.04
SUDS3-204ENST00000543473 ATP2A1O14983 1001 aa21.57■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 SLC35F6Q8N357 371 aa21.57■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 PTPN21Q16825 1174 aa21.56■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.56■■□□□ 1.04
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SUDS3-204ENST00000543473 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.54■■□□□ 1.04
SUDS3-204ENST00000543473 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.54■■□□□ 1.04
SUDS3-204ENST00000543473 SMC6Q96SB8 1091 aa21.54■■□□□ 1.04
SUDS3-204ENST00000543473 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.54■■□□□ 1.04
SUDS3-204ENST00000543473 PTCH1Q13635 1447 aa21.54■■□□□ 1.04
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