RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NFKBIEO00221 500 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD17O75943 681 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE4BQ07343 736 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS33BQ9H267 617 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 USP25Q9UHP3 1055 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CLIC4Q9Y696 253 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PICALMQ13492 652 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQ27 194 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQ64 194 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQD8 194 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD14O00487 310 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NMT2O60551 498 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R5BQ15173 497 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 FSIP1Q8NA03 581 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 BCS1LQ9Y276 419 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SPTLC2O15270 562 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 KINO60870 393 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO1Q5XXA6 986 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCBQ8NB91 859 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NFIAQ12857 509 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 GMLQ99445 158 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCA1Q86XH1 822 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH8P13535 1937 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY5O95622 1261 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK8P49336 464 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SIPA1L1O43166 1804 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CAVIN2O95810 425 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 RASA1P20936 1047 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNB3P54284 484 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 TFAP4Q01664 338 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 NIM1KQ8IY84 436 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPY2A6NKD2 308 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 DEXIO95424 95 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 PRELPP51888 382 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A14Q15043 492 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP100Q494V2 611 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF11Q86T75 865 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL9Q07325 125 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 GABPAQ06546 454 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCB2Q00722 1185 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 JMYQ8N9B5 988 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH6P13533 1939 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP1P03956 469 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CALM1P0DP23 149 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CALM2P0DP24 149 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 CALM3P0DP25 149 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCY1A2P33402 732 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF7Q02833 373 aa23.35■■□□□ 1.33
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