RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531658.1

C11orf58-210, Transcript of chromosome 11 open reading frame 58, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C11orf58, Length 4,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf58-210ENST00000531658 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 NEK1Q96PY6 1258 aa5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 AKR1B10O60218 316 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TBC1D8O95759 1140 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 HADHAP40939 763 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 CAMK2BQ13554 666 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DSG2Q14126 1118 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TMC4Q7Z404 712 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 KCT2Q8NC54 265 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ABCC11Q96J66 1382 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 FAM83GA6ND36 823 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 MSL3P1P0C860 447 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 CCND1P24385 295 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 MPSTP25325 297 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PDE6CP51160 858 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 WTAPQ15007 396 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ELF2Q15723 593 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SDF4Q9BRK5 362 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PTCH1Q13635 1447 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ENPP3O14638 875 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PDE8AO60658 829 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 AP1B1Q10567 949 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 MFSD10Q14728 455 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 21.8
C11orf58-210ENST00000531658 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 RADILQ96JH8 1075 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 EXOC1Q9NV70 894 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ABCC3O15438 1527 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 KDM5CP41229 1560 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SHROOM2Q13796 1616 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TSPOAP1O95153 1857 aa5.86□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DCCP43146 1447 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PMM2O15305 246 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 OATP04181 439 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DESP17661 470 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 OSBPP22059 807 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SERPINB3P29508 390 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 HSPA1LP34931 641 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 BPIFB3P59826 476 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 EHHADHQ08426 723 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 DCLK2Q8N568 766 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 H3BRJ5 948 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLC5A1P13866 664 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 NEK2P51955 445 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ARHGAP4P98171 946 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 C11orf74Q86VG3 221 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 CNKSR1Q969H4 720 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 BTG4Q9NY30 223 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 NOD1Q9Y239 953 aa5.85□□□□□ -1.47
C11orf58-210ENST00000531658 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms