RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 ERVK-9P63128 1117 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 ERVK-24P63145 666 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 GABPAQ06546 454 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 LCORLQ8N3X6 602 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 ACER1Q8TDN7 264 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 PORCNQ9H237 461 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 PARP14Q460N5 1801 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP2B6P20813 491 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 GUCY1A2P33402 732 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 CNMDO75829 334 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP2D6P10635 497 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 VCAM1P19320 739 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 MAPK4P31152 587 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 ARMT1Q9H993 441 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 CABP5Q9NP86 173 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 RPTORQ8N122 1335 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L15C9J2P7 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L11C9JVI0 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L18D6R9N7 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L22D6RA61 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L19D6RCP7 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L20D6RJB6 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CAPN2P17655 700 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP5JP18859 108 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP14P54578 494 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP17L24Q0WX57 530 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SEPT2Q15019 361 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 GPR142Q7Z601 462 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 USP6NLQ92738 828 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CHGBP05060 677 aa18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ADD2P35612 726 aa18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PDE3AQ14432 1141 aa18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PRKAB2O43741 272 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 MBD4O95243 580 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CCL14Q16627 93 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 MORN1Q5T089 497 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 HAUS7Q99871 368 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A1W2PRG0 241 aa18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 LBX2Q6XYB7 198 aa18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 BTBD7Q9P203 1132 aa18.92■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SMIM22K7EJ46 135 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 EVI5O60447 810 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 RGS2P41220 211 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 APBA2Q99767 749 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 PRO3102Q9H379 93 aa18.91■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SWAP70Q9UH65 585 aa18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 SZT2Q5T011 3432 aa18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.89■□□□□ 0.61
KCNQ1-206ENST00000526095 CCNA1P78396 465 aa18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms