RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523961.5

CCNC-216, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5

Gene CCNC, Length 1,152 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-216ENST00000523961 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 FKTNO75072 461 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 FGAP02671 866 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 AKR1B1P15121 316 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 PDE4BQ07343 736 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 FEZ1Q99689 392 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 ZMYM6O95789 1325 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 RAD50Q92878 1312 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 PTPRFP10586 1907 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 TLR2O60603 784 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 RASA1P20936 1047 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 CHMLP26374 656 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 USP14P54578 494 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 67.8
CCNC-216ENST00000523961 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNC-216ENST00000523961 ICA1Q05084 483 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TREML2Q5T2D2 321 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SKAP1Q86WV1 359 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ACER1Q8TDN7 264 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 PNMA3Q9UL41 463 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 MYH8P13535 1937 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 PRDM1O75626 825 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 OSBPP22059 807 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 DSG3P32926 999 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SP3Q02447 781 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 C12orf42Q96LP6 360 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SH2D4AQ9H788 454 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CYP2C8P10632 490 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 DGKZQ13574 1117 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ERO1AQ96HE7 468 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 A0A1W2PRG0 241 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TSPY3P0CV98 308 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TSPY8P0CW00 308 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 C17orf99Q6UX52 265 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 IL25Q9H293 177 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 CPA4Q9UI42 421 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TMX2Q9Y320 296 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ZNF213O14771 459 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 SGSM2O43147 1006 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ORC4O43929 436 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 FGRP09769 529 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 HAND2P61296 217 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TFAP4Q01664 338 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ATP2B2Q01814 1243 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 ARHGEF6Q15052 776 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TNS4Q8IZW8 715 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 LPAR1Q92633 364 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 NYAP2Q9P242 653 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 TSPY2A6NKD2 308 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L15C9J2P7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L11C9JVI0 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L18D6R9N7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L22D6RA61 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L19D6RCP7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L20D6RJB6 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 BCRP11274 1271 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 VCAM1P19320 739 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 USP17L24Q0WX57 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 KIF22Q14807 665 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNC-216ENST00000523961 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms