RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 HIP1O00291 1037 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PSMD14O00487 310 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RAD17O75943 681 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 CYP7A1P22680 504 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRR20EP86478 221 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRR20CP86479 221 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRR20DP86480 221 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRR20BP86481 221 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRR20AP86496 221 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 CXCL9Q07325 125 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 MAP3K12Q12852 859 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 IRF5Q13568 498 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 STRIP1Q5VSL9 837 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ERICH6Q7L0X2 663 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 LCORLQ8N3X6 602 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 MIGA1Q8NAN2 632 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RAI14Q9P0K7 980 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PALD1Q9ULE6 856 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GAKO14976 1311 aa10□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SHTN1A0MZ66 631 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 USP17L3A6NCW0 530 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 USP17L4A6NCW7 530 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 FZD9O00144 591 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SIAH2O43255 324 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GPAA1O43292 621 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 MBD4O95243 580 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 FBXO45P0C2W1 286 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 NR1H3Q13133 447 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 CYP4X1Q8N118 509 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ADAM32Q8TC27 787 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ARMT1Q9H993 441 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SMIM22K7EJ46 135 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 PRKAB2O43741 272 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GFRA3O60609 400 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RHBDL3P58872 404 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 CASC1Q6TDU7 716 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 NIM1KQ8IY84 436 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 MAP4K1Q92918 833 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 KCNB2Q92953 911 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 F8W031 263 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 LMNB1P20700 586 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SCNN1DP51172 638 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ARID5BQ14865 1188 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 NECTIN1Q15223 517 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 IL17RAQ96F46 866 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA13-202ENST00000518136 REC8O95072 547 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 HSPA4P34932 840 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 BTDP43251 543 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 VAC14Q08AM6 782 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 WDR90Q96KV7 1748 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXA13-202ENST00000518136 SCN4AP35499 1836 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms