RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 MAP7Q14244 749 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 PPM1JQ5JR12 505 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 PICK1Q9NRD5 415 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 ATP7AQ04656 1500 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 A2MP01023 1474 aa9.35□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 DYRK3O43781 588 aa9.35□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 CDK8P49336 464 aa9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-225ENST00000515835 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.35□□□□□ -0.91
PDE4D-225ENST00000515835 PAOXQ6QHF9 649 aa9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-225ENST00000515835 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-225ENST00000515835 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 HMX2A2RU54 273 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 KCT2Q8NC54 265 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 ISL2Q96A47 359 aa9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 ZMYM3Q14202 1370 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.31□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 FSTP19883 344 aa9.3□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 GRK4P32298 578 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 PDE4BQ07343 736 aa9.3□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 GGT6Q6P531 493 aa9.3□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.3□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 IGLV1-40P01703 118 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 CRKP46108 304 aa9.29□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 HID1Q8IV36 788 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.28□□□□□ -0.92
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PDE4D-225ENST00000515835 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 PTPRKQ15262 1439 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.28□□□□□ -0.92
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