RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CUTA	O60888	179 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SASH3	O75995	380 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D8	O95759	1140 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TPM1	P09493	284 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ADORA1	P30542	326 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SYK	P43405	635 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE4B	Q07343	736 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IRF5	Q13568	498 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BAP1	Q92560	729 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	APPBP2	Q92624	585 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MED15	Q96RN5	788 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	STK36	Q9NRP7	1315 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ALS2	Q96Q42	1657 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN12	O43309	604 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NRDC	O43847	1150 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC27	P30260	824 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBASH3A	P57075	661 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PNOC	Q13519	176 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SCARF1	Q14162	830 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ALX1	Q15699	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NTRK3	Q16288	839 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	WASHC4	Q2M389	1173 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT40	Q6A162	431 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS37D	Q86XT2	251 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	JMY	Q8N9B5	988 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TC2N	Q8N9U0	490 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBXN4	Q92575	508 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	AIFM3	Q96NN9	605 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR24	Q96S15	920 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CARD6	Q9BX69	1037 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FANCL	Q9NW38	375 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TNS2	Q63HR2	1409 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	C4A	P0C0L4	1744 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	C4B	P0C0L5	1744 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LRP6	O75581	1613 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF1A	Q12756	1690 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JS52	829 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NPHP1	O15259	732 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	STX10	O60499	249 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKL5	O76039	1030 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5

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