RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE4AP27815 886 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 GJA8P48165 433 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 OLFM4Q6UX06 510 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 BHMTQ93088 406 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM165Q9HC07 324 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 IFT57Q9NWB7 429 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD14O00487 310 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA2O43364 376 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 DOK7Q18PE1 504 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.579e-54■■■■■ 28.8
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RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOCDQ8IZQ8 938 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM89AQ96GI7 184 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP63Q96MT8 703 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SCINQ9Y6U3 715 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TNNI2P48788 182 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFAIP1Q13829 316 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF22Q14807 665 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-213ENST00000496055 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 GGA3Q9NZ52 723 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CHL1O00533 1208 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 AOC2O75106 756 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPA1O75762 1119 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX4P57082 545 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 DLGAP5Q15398 846 aa5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.25□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM66O15016 1216 aa5.24□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 GPSM2P81274 684 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SCARF1Q14162 830 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 BECN1Q14457 450 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPROQ16827 1216 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.24□□□□□ -1.57
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RABGGTB-213ENST00000496055 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 NACC2Q96BF6 587 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPTQ96BT3 561 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CDCA5Q96FF9 252 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 RMDN2Q96LZ7 410 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP89Q96ST8 783 aa5.24□□□□□ -1.57
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