RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	BRD1	O95696	1058 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	RAC2	P15153	192 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00310	P59036	64 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	SLC6A19	Q695T7	634 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	SPG7	Q9UQ90	795 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	INHBB	P09529	407 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	MAPK8	P45983	427 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	NR0B2	Q15466	257 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	RNF32	Q9H0A6	362 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	PEX10	O60683	326 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	HOXA5	P20719	270 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ETV3	P41162	512 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	HK2	P52789	917 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	SEPT6	Q14141	434 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	LILRA2	Q8N149	483 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	KCNN1	Q92952	543 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	SHISA4	Q96DD7	197 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	GCM1	Q9NP62	436 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	PGR	P06401	933 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	EBF1	Q9UH73	591 aa		5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTC3-222	ENST00000491952	SEMA7A	O75326	666 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	GNA15	P30679	374 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	LIG3	P49916	1009 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	DLG4	P78352	724 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	NOTO	A8MTQ0	251 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	NUAK1	O60285	661 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CTSW	P56202	376 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	ATP2B2	Q01814	1243 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	C14orf37	Q86TY3	774 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	KCNC2	Q96PR1	638 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	AK5	Q9Y6K8	562 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	EGR3	Q06889	387 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	SNX17	Q15036	470 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	RNF141	Q8WVD5	230 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	VWCE	Q96DN2	955 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		5.87	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	EFEMP2	O95967	443 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	TEK	Q02763	1124 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	PDE4B	Q07343	736 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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