RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490108.1

TSC2-215, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 4

Gene TSC2, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-215ENST00000490108 ACER1Q8TDN7 264 aa24.19■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 C12orf42Q96LP6 360 aa24.19■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 MBD4O95243 580 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 CYP2D6P10635 497 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 ATP5JP18859 108 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 CYP2B6P20813 491 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 TRIM32Q13049 653 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 PDE3AQ14432 1141 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L15C9J2P7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L11C9JVI0 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L18D6R9N7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L22D6RA61 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L19D6RCP7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L20D6RJB6 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 VCAM1P19320 739 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 MAPK4P31152 587 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 ADD2P35612 726 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 GABPAQ06546 454 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 USP17L24Q0WX57 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 HAUS7Q99871 368 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.462e-9■■■■□ 20.5
TSC2-215ENST00000490108 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 PORCNQ9H237 461 aa24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 GUCY1A2P33402 732 aa24.16■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 SEPT2Q15019 361 aa24.16■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 Q3C1V9 767 aa24.16■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 TRIB2Q92519 343 aa24.16■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 MYH7P12883 1935 aa24.16■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 PRKAB2O43741 272 aa24.15■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.15■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.15■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.15■■□□□ 1.46
TSC2-215ENST00000490108 CHGBP05060 677 aa24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 GPR142Q7Z601 462 aa24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 MYH8P13535 1937 aa24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.13■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.13■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.13■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.13■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 RPTORQ8N122 1335 aa24.12■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CNMDO75829 334 aa24.12■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CAPN2P17655 700 aa24.12■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 RGS2P41220 211 aa24.12■■□□□ 1.45
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TSC2-215ENST00000490108 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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TSC2-215ENST00000490108 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.12■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CCNA1P78396 465 aa24.11■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.11■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 A0A1W2PRG0 241 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 UBE3CQ15386 1083 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 MORN1Q5T089 497 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 APBA2Q99767 749 aa24.1■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 AKR1B1P15121 316 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CCL14Q16627 93 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 USP6NLQ92738 828 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 BTBD7Q9P203 1132 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.09■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 EVI5O60447 810 aa24.08■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.08■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.08■■□□□ 1.45
TSC2-215ENST00000490108 SMIM22K7EJ46 135 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 ICA1Q05084 483 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 LBX2Q6XYB7 198 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 GPATCH3Q96I76 525 aa24.07■■□□□ 1.44
TSC2-215ENST00000490108 ALPK3Q96L96 1907 aa24.06■■□□□ 1.44
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