RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 FAM168AQ92567 244 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 C12orf49Q9H741 205 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 SPG7Q9UQ90 795 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.54□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 ABCC1P33527 1531 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 FANCAO15360 1455 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 NEO1Q92859 1461 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 ENC1O14682 589 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 GIPC1O14908 333 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 PAGE1O75459 146 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 RNF19AQ9NV58 838 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 GLI2P10070 1586 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 TONSLQ96HA7 1378 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 KIF15Q9NS87 1388 aa5.53□□□□□ -1.52
RARB-208ENST00000489694 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 USP17L7P0C7H9 530 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 NTF4P34130 210 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 RASIP1Q5U651 963 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.52□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ATP10AO60312 1499 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CD109Q6YHK3 1445 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CELA3AP09093 270 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 GNA15P30679 374 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CEP44Q9C0F1 390 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CBX8Q9HC52 389 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.51□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 BMP6P22004 513 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZNF124Q15973 351 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PPM1JQ5JR12 505 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 NUP155O75694 1391 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 UNC13BO14795 1591 aa5.5□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 TRIM37O94972 964 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 IKZF1Q13422 519 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ASB11Q8WXH4 323 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FRMD6Q96NE9 622 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PICK1Q9NRD5 415 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SAMM50Q9Y512 469 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CSADQ9Y600 493 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ADGRL1O94910 1474 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PZPP20742 1482 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.49□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 KDM5CP41229 1560 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 KANK1Q14678 1352 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DBX1A6NMT0 343 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 CLCN7P51798 805 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 RING1Q06587 406 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PKN1Q16512 942 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.48□□□□□ -1.53
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