RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L22D6RA61 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L19D6RCP7 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L20D6RJB6 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 RLBP1P12271 317 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L24Q0WX57 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 WDR78Q5VTH9 848 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 LHX8Q68G74 356 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K12Q12852 859 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 MAP2K5Q13163 448 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 Q7L0L9 218 aa22.48■■□□□ 1.19
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PTPRN-217ENST00000489650 EHD4Q9H223 541 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 CABP5Q9NP86 173 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 BTBD7Q9P203 1132 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 PTPREP23469 700 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 SHMT1P34896 483 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRN-217ENST00000489650 CEP85Q6P2H3 762 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 TDHQ8IZJ6 230 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB123Q8N688 67 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRN-217ENST00000489650 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.44■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.43■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 ATP2B2Q01814 1243 aa22.43■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PRG0 241 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 GPR153Q6NV75 609 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 LBX2Q6XYB7 198 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 TRPV1Q8NER1 839 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-217ENST00000489650 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 PANK1Q8TE04 598 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRN-217ENST00000489650 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 ANO1Q5XXA6 986 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 DPP9Q86TI2 863 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 LPAR1Q92633 364 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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