RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L10C9JJH3 530 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PRDM1O75626 825 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 PDE4BQ07343 736 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 ACER1Q8TDN7 264 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 FEZ1Q99689 392 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-216ENST00000486480 MYH4Q9Y623 1939 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 C19orf81C9J6K1 198 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 TREML2Q5T2D2 321 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 GPR25O00155 361 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 SGSM2O43147 1006 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ICA1Q05084 483 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 HAND2P61296 217 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 C12orf42Q96LP6 360 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1W2PRG0 241 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 TLR2O60603 784 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 CYP2C8P10632 490 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 USP14P54578 494 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 NBPF3Q9H094 633 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 ORC4O43929 436 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 FGRP09769 529 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 INCENPQ9NQS7 918 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA3Q9UL41 463 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 FKTNO75072 461 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TSPY3P0CV98 308 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TSPY8P0CW00 308 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 SH2D4AQ9H788 454 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TMX2Q9Y320 296 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF213O14771 459 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 CDC45O75419 566 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 VCAM1P19320 739 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 ATP2B2Q01814 1243 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 PTH1RQ03431 593 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 PARP14Q460N5 1801 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TFAP4Q01664 338 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 CEP95Q96GE4 821 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TOMM22Q9NS69 142 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 CPA4Q9UI42 421 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 MGAMO43451 1857 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 TSPY2A6NKD2 308 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 OSBPP22059 807 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 SP3Q02447 781 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 C17orf99Q6UX52 265 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 VCPKMTQ9H867 229 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 NYAP2Q9P242 653 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 NEDD4P46934 1319 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 CASC1Q6TDU7 716 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 LPAR1Q92633 364 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 RLFQ13129 1914 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 BCRP11274 1271 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.65■■□□□ 1.22
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