RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.63□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CBX8Q9HC52 389 aa6.63□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 MYOM1P52179 1685 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 USP32Q8NFA0 1604 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 DLC1Q96QB1 1528 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 DLGAP3O95886 979 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PWP1Q13610 501 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 RHOVQ96L33 236 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CORO1BQ9BR76 489 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.62□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CEP162Q5TB80 1403 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ZBTB7AO95365 584 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 WISP1O95388 367 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 GRIK4Q16099 956 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 KCNB2Q92953 911 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PXDNQ92626 1479 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ERBINQ96RT1 1412 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PF4P02776 101 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 GARTP22102 1010 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LRRC14Q15048 493 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ADGRL2O95490 1459 aa6.6□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 KIF15Q9NS87 1388 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 SELPP16109 830 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 LMNB2Q03252 620 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 SEPT6Q14141 434 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.59□□□□□ -1.35
HFE-212ENST00000485729 ZNF862O60290 1169 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 LIG1P18858 919 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 LMNB1P20700 586 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 PDE3AQ14432 1141 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 ACAD11Q709F0 780 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 KRT82Q9NSB4 513 aa6.58□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 CASZ1Q86V15 1759 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 TNNI2P48788 182 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 SPON2Q9BUD6 331 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 BTG4Q9NY30 223 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 STK17AQ9UEE5 414 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 UTRNP46939 3433 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 METP08581 1390 aa6.57□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 MEGF11A6BM72 1044 aa6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 F8W735 103 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 GREM1O60565 184 aa6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 F13A1P00488 732 aa6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HFE-212ENST00000485729 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms