RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	UBOX5	O94941	541 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	BEND4	Q6ZU67	534 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	NBPF4	Q96M43	638 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	RGS13	O14921	159 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	LRIG2	O94898	1065 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	MAP7	Q14244	749 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	DDR2	Q16832	855 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM192	Q8IY95	271 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	MIPEP	Q99797	713 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	DDAH1	O94760	285 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	SLITRK5	O94991	958 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	GJB6	O95452	261 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	GBP1	P32455	592 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	GATA4	P43694	442 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	FXN	Q16595	210 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	TP53INP1	Q96A56	240 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TARBP1-208	ENST00000484454	HMX2	A2RU54	273 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	LEFTY1	O75610	366 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	FURIN	P09958	794 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454		C9IYK1	514 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	ADM	P35318	185 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	VHLL	Q6RSH7	139 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SHISA5	Q8N114	240 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CLEC3A	O75596	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM87A	P0C7U9	286 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CCNF	P41002	786 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	RASA3	Q14644	834 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	NFE2L2	Q16236	605 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MKL1	Q969V6	931 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	STOML1	Q9UBI4	398 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	EOMES	O95936	686 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	GATA6	Q92908	595 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PDPK1	O15530	556 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TARBP1-208	ENST00000484454	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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