RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	SYNE4	Q8N205	404 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	USP47	Q96K76	1375 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	MMP20	O60882	483 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SPINK2	P20155	84 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SSFA2	P28290	1259 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	EPHX2	P34913	555 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	UVSSA	Q2YD98	709 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	LINC01387	J3KSC0	135 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ADAMTS4	O75173	837 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SOX18	P35713	384 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DPYD	Q12882	1025 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ACAD11	Q709F0	780 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	MYO19	Q96H55	970 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	HMX2	A2RU54	273 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	IL2RB	P14784	551 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	PALLD	Q8WX93	1383 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ACE	P12821	1306 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	KRT37	O76014	449 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	GYS1	P13807	737 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DDR1	Q08345	913 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	PTK7	Q13308	1070 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SPACA7	Q96KW9	195 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	HACL1	Q9UJ83	578 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	INSR	P06213	1382 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	TMF1	P82094	1093 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	NOG	Q13253	232 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	GUCD1	Q96NT3	240 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	NUP155	O75694	1391 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RAB18-205	ENST00000484281	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	WISP1	O95388	367 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	CDC27	P30260	824 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	WEE1	P30291	646 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	FLII	Q13045	1269 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	REV3L	O60673	3130 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	PIK3C2G	O75747	1445 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RAB18-205	ENST00000484281	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.01	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms