RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CCL5P13501 91 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 HERVK_113P62684 666 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 OSBP2Q969R2 916 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 GJD2Q9UKL4 321 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 AKR1B1P15121 316 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 C12orf60Q5U649 245 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CTR9Q6PD62 1173 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 SHISA4Q96DD7 197 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 FEZ1Q99689 392 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CABP5Q9NP86 173 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CDK8P49336 464 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 TRIM32Q13049 653 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 COA7Q96BR5 231 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 RNF208Q9H0X6 261 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 PORCNQ9H237 461 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 PARP14Q460N5 1801 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 M0R2C6 588 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CNMDO75829 334 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 INHAP05111 366 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 VCAM1P19320 739 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 C12orf42Q96LP6 360 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L15C9J2P7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L11C9JVI0 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L18D6R9N7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L22D6RA61 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L19D6RCP7 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L20D6RJB6 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L24Q0WX57 530 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 IRF5Q13568 498 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 GPATCH3Q96I76 525 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 GJB1P08034 283 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CYP2B6P20813 491 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ERVK-9P63128 1117 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ERVK-24P63145 666 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 UBXN2AP68543 259 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 BTBD7Q9P203 1132 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SWAP70Q9UH65 585 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 MYH4Q9Y623 1939 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.64■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GJA8P48165 433 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 USP14P54578 494 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 APPBP2Q92624 585 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GPAA1O43292 621 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 MX1P20591 662 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TRIB2Q92519 343 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 DEFB118Q96PH6 123 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ALPK3Q96L96 1907 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SGPL1O95470 568 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ATP2B2Q01814 1243 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CCL14Q16627 93 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GPR142Q7Z601 462 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 USP6NLQ92738 828 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ERC2O15083 957 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 IGHDP01880 384 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 APPP05067 770 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms