RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA1Q5VX52 437 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 SETDB2Q96T68 719 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ABCF2Q9UG63 623 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 NARFQ9UHQ1 456 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ZPR1O75312 459 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 RPS6KA4O75676 772 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF18P17022 549 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 TROAPQ12815 778 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 STIM1Q13586 685 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 HOMER1Q86YM7 354 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 CNGA4Q8IV77 575 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 MPNDQ8N594 471 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 DNAI1Q9UI46 699 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 POTEB2H3BUK9 544 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 ADAMTS2O95450 1211 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 PRPHP41219 470 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 TMC4Q7Z404 712 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 NLRP5P59047 1200 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRD-209ENST00000477552 CCDC93Q567U6 631 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-209ENST00000477552 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.5□□□□□ -0.89
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