RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475965.1

HDAC10-210, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-210ENST00000475965 COL6A3P12111 3177 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L15C9J2P7 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L11C9JVI0 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L18D6R9N7 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L22D6RA61 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L19D6RCP7 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L20D6RJB6 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP14P54578 494 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 USP17L24Q0WX57 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 APBA2Q99767 749 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 MORN1Q5T089 497 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 CCNA1P78396 465 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 CABP5Q9NP86 173 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-210ENST00000475965 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CCL14Q16627 93 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 GDF15Q99988 308 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CNMDO75829 334 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 VCAM1P19320 739 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 BMP8BP34820 402 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SHMT1P34896 483 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MAP2K5Q13163 448 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PFASO15067 1338 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PLCD1P51178 756 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 WDR78Q5VTH9 848 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 ACER1Q8TDN7 264 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PANK1Q8TE04 598 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MYH7P12883 1935 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 LBX2Q6XYB7 198 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.11■■□□□ 1.13
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HDAC10-210ENST00000475965 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 COL6A1P12109 1028 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PDE6AP16499 860 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SYN1P17600 705 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 LHX8Q68G74 356 aa22.1■■□□□ 1.13
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HDAC10-210ENST00000475965 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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HDAC10-210ENST00000475965 RLFQ13129 1914 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PTPREP23469 700 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 GUCY1A2P33402 732 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 GABPAQ06546 454 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 BTBD7Q9P203 1132 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MS4A1P11836 297 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 SEPT2Q15019 361 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC10-210ENST00000475965 A0A0C4DFX4 3053 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 GOLIM4O00461 696 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 GRB14Q14449 540 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 PARP14Q460N5 1801 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 APBB1O00213 710 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 HMMRO75330 724 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 HOXC6P09630 235 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 MIER1Q8N108 512 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 ATP2B2Q01814 1243 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 EVX2Q03828 476 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 GPR153Q6NV75 609 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 TDHQ8IZJ6 230 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 LCORLQ8N3X6 602 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-210ENST00000475965 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.05■■□□□ 1.12
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