RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL25	Q9H293	177 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDM1	O75626	825 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAT2	P19087	354 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASA1	P20936	1047 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	FEZ1	Q99689	392 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	APP	P05067	770 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	VCAM1	P19320	739 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	SDS	P20132	328 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	ICA1	Q05084	483 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPARA	Q07869	468 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAPB	Q9H115	298 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSBP	P22059	807 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMC4	P43686	418 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	HERVK_113	P62684	666 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNMD	O75829	334 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOX10	P56693	466 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP14	P54578	494 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	HAND2	P61296	217 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGA	P02671	866 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF22	Q14807	665 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALX1	Q15699	326 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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