RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L19D6RCP7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L20D6RJB6 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 USP17L24Q0WX57 530 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ACER1Q8TDN7 264 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 C12orf42Q96LP6 360 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.35■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.34■■□□□ 1.33
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SHQ1-206ENST00000471526 USP14P54578 494 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 GPR142Q7Z601 462 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
SHQ1-206ENST00000471526 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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SHQ1-206ENST00000471526 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 RAB11FIP3O75154 756 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 EVX2Q03828 476 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
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SHQ1-206ENST00000471526 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.32■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 VCAM1P19320 739 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 GUCY1A2P33402 732 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 RGS2P41220 211 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 GABPAQ06546 454 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT2Q15019 361 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CCL14Q16627 93 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 MORN1Q5T089 497 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 WDR78Q5VTH9 848 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 LCORLQ8N3X6 602 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 USP6NLQ92738 828 aa23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CNMDO75829 334 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 NBPF3Q9H094 633 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 ARMT1Q9H993 441 aa23.3■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CEP290O15078 2479 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CYP2D6P10635 497 aa23.29■■□□□ 1.32
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SHQ1-206ENST00000471526 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 PRO3102Q9H379 93 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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SHQ1-206ENST00000471526 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 MYH1P12882 1939 aa23.29■■□□□ 1.32
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SHQ1-206ENST00000471526 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 BTBD7Q9P203 1132 aa23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 STAP2Q9UGK3 403 aa23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.28■■□□□ 1.32
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SHQ1-206ENST00000471526 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 MAP2K5Q13163 448 aa23.27■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.27■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 APBA2Q99767 749 aa23.27■■□□□ 1.32
SHQ1-206ENST00000471526 A0A1W2PRG0 241 aa23.26■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 ADD2P35612 726 aa23.26■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.26■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 PLXNB2O15031 1838 aa23.25■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.24■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.24■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.23■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 SYN1P17600 705 aa23.22■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 ATP2B2Q01814 1243 aa23.22■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.22■■□□□ 1.31
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