RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 CYP2C19P33261 490 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 USP17L24Q0WX57 530 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 SHHQ15465 462 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 BTBD7Q9P203 1132 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 HOXC6P09630 235 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 RTP1P59025 263 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 WDR78Q5VTH9 848 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 DNM1LO00429 736 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 CCNA1P78396 465 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 ATP2B2Q01814 1243 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 GRB14Q14449 540 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 ACER1Q8TDN7 264 aa22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 FOCADQ5VW36 1801 aa22.89■■□□□ 1.26
LINC00888-201ENST00000468380 MSCO60682 206 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 HLA-DOAP06340 250 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 LBX2Q6XYB7 198 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TNNQ9UQP3 1299 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 CYBAP13498 195 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 VCAM1P19320 739 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ZAP70P43403 619 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 FEZ1Q99689 392 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.88■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 LTBP2Q14767 1821 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 GNAI2P04899 355 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TNNI3KQ59H18 835 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ANO1Q5XXA6 986 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 BADQ92934 168 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 CDH23Q9H251 3354 aa22.87■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 CYP7A1P22680 504 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 MYLIPQ8WY64 445 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 GPR108Q9NPR9 543 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 RLFQ13129 1914 aa22.86■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 GUCY1A2P33402 732 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 USP14P54578 494 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM60Q495X7 471 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TTC28Q96AY4 2481 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 COBLO75128 1261 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 SNX17Q15036 470 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 DPP9Q86TI2 863 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 EHD4Q9H223 541 aa22.83■■□□□ 1.25
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM27P14373 513 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 ADORA2AP29274 412 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 SHMT1P34896 483 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 USP5P45974 858 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 PLCD1P51178 756 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 POLA2Q14181 598 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 MYH1P12882 1939 aa22.82■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 IGSF3O75054 1194 aa22.81■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 ITGB8P26012 769 aa22.81■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.81■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PRG0 241 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms