RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 HS1BP3Q53T59 392 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CERS3Q8IU89 383 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CERS5Q8N5B7 392 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PHKBQ93100 1093 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 HPSEQ9Y251 543 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CLIC4Q9Y696 253 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC69A6NI79 296 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CPLX1O14810 134 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 DEXIO95424 95 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 APBA3O96018 575 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MMP1P03956 469 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 LDHCP07864 332 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MMP10P09238 476 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L8P0C7I0 530 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RASA1P20936 1047 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 GSTO1P78417 241 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TYRO3Q06418 890 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ANO1Q5XXA6 986 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 ADALQ6DHV7 355 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 COA1Q9GZY4 146 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FLT1P17948 1338 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NMT2O60551 498 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PPP6R2O75170 966 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM1O75626 825 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FOSBP53539 338 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 GABPAQ06546 454 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K11Q16584 847 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 STYK1Q6J9G0 422 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 OLFM4Q6UX06 510 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 DGKHQ86XP1 1220 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 JAG2Q9Y219 1238 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 COL4A5P29400 1685 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD18B2RXH4 712 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SPTLC2O15270 562 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE5O15320 804 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CALM1P0DP23 149 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CALM2P0DP24 149 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CALM3P0DP25 149 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 CMA1P23946 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6BP35913 854 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 BTDP43251 543 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 PLCD1P51178 756 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA8P51970 172 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 GRM4Q14833 912 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IQCB1Q15051 598 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 RESP18Q5W5W9 173 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-210ENST00000462363 SHC4Q6S5L8 630 aa6.54□□□□□ -1.36
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