RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 C12orf60Q5U649 245 aa25.27■■□□□ 1.64
LTB-211ENST00000446745 CCDC17Q96LX7 622 aa25.27■■□□□ 1.64
LTB-211ENST00000446745 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.27■■□□□ 1.64
LTB-211ENST00000446745 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
LTB-211ENST00000446745 POTEFA5A3E0 1075 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L15C9J2P7 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L11C9JVI0 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L18D6R9N7 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L22D6RA61 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L19D6RCP7 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L20D6RJB6 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 CHGBP05060 677 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 USP17L24Q0WX57 530 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 SH2D4AQ9H788 454 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.26■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 IRF5Q13568 498 aa25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 SEPT2Q15019 361 aa25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 FSD1Q9BTV5 496 aa25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 FLT3LGP49771 235 aa25.24■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.24■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.24■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 GABRQQ9UN88 632 aa25.24■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 ADCY3O60266 1144 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 CTR9Q6PD62 1173 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 ACER1Q8TDN7 264 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 OSBP2Q969R2 916 aa25.23■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 GPAA1O43292 621 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 VCAM1P19320 739 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 GUCY1A2P33402 732 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 CDK8P49336 464 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 EVX2Q03828 476 aa25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 APPP05067 770 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 SBK1Q52WX2 424 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.21■■□□□ 1.63
LTB-211ENST00000446745 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 MAPK4P31152 587 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 TDO2P48775 406 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 CCNA1P78396 465 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ICA1Q05084 483 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 AKR1B1P15121 316 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ERVK-9P63128 1117 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ERVK-24P63145 666 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 LPAR1Q92633 364 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 STAP2Q9UGK3 403 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.19■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 EVI5LQ96CN4 794 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 RNF208Q9H0X6 261 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.18■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 M0R2C6 588 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 CCL5P13501 91 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.17■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ELNP15502 786 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 PDE1AP54750 535 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 MTFR1Q15390 333 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 TMX2Q9Y320 296 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.16■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 BRCA2P51587 3418 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 A0A1W2PRG0 241 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 INHAP05111 366 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 GJB1P08034 283 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 CAPN2P17655 700 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 LBX2Q6XYB7 198 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 TICAM2Q86XR7 235 aa25.15■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 ATP2B2Q01814 1243 aa25.14■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 COG2Q14746 738 aa25.14■■□□□ 1.62
LTB-211ENST00000446745 SMC5Q8IY18 1101 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms