RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 TRIB2Q92519 343 aa22.43■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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SGO1-208ENST00000437051 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.43■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.43■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 ALPK3Q96L96 1907 aa22.43■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 H0YGN5 161 aa22.42■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 MBD4O95243 580 aa22.42■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 VCAM1P19320 739 aa22.42■■□□□ 1.18
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SGO1-208ENST00000437051 ERVK-24P63145 666 aa22.42■■□□□ 1.18
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SGO1-208ENST00000437051 USP6NLQ92738 828 aa22.42■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.42■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.42■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.41■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.41■■□□□ 1.18
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SGO1-208ENST00000437051 DEFB118Q96PH6 123 aa22.41■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.41■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CEP290O15078 2479 aa22.41■■□□□ 1.18
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SGO1-208ENST00000437051 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SGO1-208ENST00000437051 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 HMGCRP04035 888 aa22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 DCTPP1Q9H773 170 aa22.39■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 MYH8P13535 1937 aa22.39■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 MORN1Q5T089 497 aa22.38■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 PARP14Q460N5 1801 aa22.38■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.37■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 USP14P54578 494 aa22.35■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 CABP5Q9NP86 173 aa22.35■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.35■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.35■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.34■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 PRO3102Q9H379 93 aa22.34■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.34■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 RPTORQ8N122 1335 aa22.33■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 USP17L12C9JPN9 530 aa22.33■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 USP17L21D6R901 530 aa22.33■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.33■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.33■■□□□ 1.17
SGO1-208ENST00000437051 SWAP70Q9UH65 585 aa22.33■■□□□ 1.17
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SGO1-208ENST00000437051 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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SGO1-208ENST00000437051 CTR9Q6PD62 1173 aa22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 DPF3Q92784 378 aa22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 OSBP2Q969R2 916 aa22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
SGO1-208ENST00000437051 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.32■■□□□ 1.16
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