RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L20D6RJB6 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L24Q0WX57 530 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 LCORLQ8N3X6 602 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 HAUS7Q99871 368 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.39■■□□□ 1.66
LIMS1-208ENST00000428064 ADD2P35612 726 aa25.38■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 LBX2Q6XYB7 198 aa25.38■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.38■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 RPTORQ8N122 1335 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 GUCY1A2P33402 732 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 DPF3Q92784 378 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.37■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 VCAM1P19320 739 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 Q3C1V9 767 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 TRIB2Q92519 343 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 USP6NLQ92738 828 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 SWAP70Q9UH65 585 aa25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 MYH8P13535 1937 aa25.35■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 ACER1Q8TDN7 264 aa25.35■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 PORCNQ9H237 461 aa25.35■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 PEX10O60683 326 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 UBE3CQ15386 1083 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 MORN1Q5T089 497 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 GPR142Q7Z601 462 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 ARMT1Q9H993 441 aa25.34■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 CNMDO75829 334 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2B6P20813 491 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 CCNA1P78396 465 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT2Q15019 361 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.33■■□□□ 1.65
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 MBD4O95243 580 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 RGS2P41220 211 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 EVX2Q03828 476 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM32Q13049 653 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.31■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 APBA2Q99767 749 aa25.31■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CEP290O15078 2479 aa25.31■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.3■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 BCL11AQ9H165 835 aa25.3■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRG0 241 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAB2O43741 272 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2D6P10635 497 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf60Q5U649 245 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 ALPK3Q96L96 1907 aa25.29■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 RLFQ13129 1914 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K5Q13163 448 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC17Q96LX7 622 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 PRO3102Q9H379 93 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD7Q9P203 1132 aa25.28■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 LPAR1Q92633 364 aa25.27■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 DCTPP1Q9H773 170 aa25.27■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 EVI5O60447 810 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC6P09630 235 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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