RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-204	ENST00000427778	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LINC00963-204	ENST00000427778	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	TLR2	O60603	784 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	MBD4	O95243	580 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GABPA	Q06546	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	NBPF11	Q86T75	865 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	APPBP2	Q92624	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PDHX	O00330	501 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	CHGB	P05060	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SHMT1	P34896	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PLCD1	P51178	756 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PDE1A	P54750	535 aa		10.62	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	SP3	Q02447	781 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	TRIM75P	A6NK02	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	IGHD	P01880	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	SPP2	Q13103	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
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LINC00963-204	ENST00000427778	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	C19orf81	C9J6K1	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PRKAB2	O43741	272 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GNRH1	P01148	92 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	BCR	P11274	1271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GNAT2	P19087	354 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	BACE1	P56817	501 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	C12orf60	Q5U649	245 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	DPF3	Q92784	378 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	RLF	Q13129	1914 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	USP17L10	C9JJH3	530 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GPAA1	O43292	621 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GDF11	O95390	407 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	GH2	P01242	217 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	HMGCS2	P54868	508 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
LINC00963-204	ENST00000427778	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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