RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421510.5

EHD1-204, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EHD1, Length 1,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-204ENST00000421510 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.62■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.62■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L15C9J2P7 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L11C9JVI0 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L18D6R9N7 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L22D6RA61 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L19D6RCP7 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L20D6RJB6 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 SGPL1O95470 568 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 HMGCRP04035 888 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 VCAM1P19320 739 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 ERVK-9P63128 1117 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 ERVK-24P63145 666 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 USP17L24Q0WX57 530 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 UBE3CQ15386 1083 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 DEFB118Q96PH6 123 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 PLXNB2O15031 1838 aa24.61■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 DCTPP1Q9H773 170 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.6■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 MAPK4P31152 587 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 Q3C1V9 767 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 PORCNQ9H237 461 aa24.59■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 CYP2B6P20813 491 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 SWAP70Q9UH65 585 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 MYH7P12883 1935 aa24.58■■□□□ 1.53
EHD1-204ENST00000421510 H0YGN5 161 aa24.57■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 TRIM32Q13049 653 aa24.57■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 TRIB2Q92519 343 aa24.57■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.57■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 A0A1W2PRG0 241 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CNMDO75829 334 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 GPR142Q7Z601 462 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 DPF3Q92784 378 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 SMIM22K7EJ46 135 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CAPN2P17655 700 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 C12orf60Q5U649 245 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 GPATCH3Q96I76 525 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 USP17L12C9JPN9 530 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 USP17L21D6R901 530 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 AKR1B1P15121 316 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 LBX2Q6XYB7 198 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 USP6NLQ92738 828 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CCNA1P78396 465 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 MORN1Q5T089 497 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 RPTORQ8N122 1335 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 RGS2P41220 211 aa24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 CDK8P49336 464 aa24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 BTBD7Q9P203 1132 aa24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 MYH8P13535 1937 aa24.52■■□□□ 1.52
EHD1-204ENST00000421510 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 ICA1Q05084 483 aa24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 CCDC17Q96LX7 622 aa24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 APBA2Q99767 749 aa24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 WDR78Q5VTH9 848 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 CTR9Q6PD62 1173 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD1-204ENST00000421510 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms