RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 PTPRFP10586 1907 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 TLR2O60603 784 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 SEPT2Q15019 361 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 ALX1Q15699 326 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-201ENST00000416295 AKR1B1P15121 316 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 GUCY1A2P33402 732 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 USP14P54578 494 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PDE4BQ07343 736 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PPARAQ07869 468 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PNMA3Q9UL41 463 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ZMYM6O95789 1325 aa21.45■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.44■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 SP3Q02447 781 aa21.44■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 TREML2Q5T2D2 321 aa21.44■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.44■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 RASA1P20936 1047 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ICA1Q05084 483 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ERO1AQ96HE7 468 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 MYH8P13535 1937 aa21.43■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 FGAP02671 866 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 CYP2C8P10632 490 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 OSBPP22059 807 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ACER1Q8TDN7 264 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 RAD50Q92878 1312 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 C12orf42Q96LP6 360 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 SH2D4AQ9H788 454 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.42■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 C17orf99Q6UX52 265 aa21.41■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.41■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.41■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 CHMLP26374 656 aa21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF6Q15052 776 aa21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 CPA4Q9UI42 421 aa21.4■■□□□ 1.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PRDM1O75626 825 aa21.39■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF22Q14807 665 aa21.39■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.39■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A1W2PRG0 241 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 TMX2Q9Y320 296 aa21.38■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY3P0CV98 308 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY8P0CW00 308 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 BCRP11274 1271 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 VCAM1P19320 739 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP2B2Q01814 1243 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 LPAR1Q92633 364 aa21.37■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L15C9J2P7 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L11C9JVI0 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L18D6R9N7 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L22D6RA61 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L19D6RCP7 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L20D6RJB6 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 USP17L24Q0WX57 530 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 SKAP1Q86WV1 359 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM17Q9Y577 477 aa21.36■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ORC4O43929 436 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 FGRP09769 529 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 SOX10P56693 466 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 VCPKMTQ9H867 229 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 EFCC1Q9HA90 598 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GOPCQ9HD26 462 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 NYAP2Q9P242 653 aa21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.34■■□□□ 1.01
SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY2A6NKD2 308 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms