RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.91■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.91■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 A0A1W2PQ27 194 aa21.9■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 A0A1W2PQ64 194 aa21.9■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 A0A1W2PQD8 194 aa21.9■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 DACT2Q5SW24 774 aa21.89■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.88■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.88■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.87■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP39-202ENST00000409025 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.87■■□□□ 1.09
USP39-202ENST00000409025 SCN9AQ15858 1988 aa21.87■■□□□ 1.09
USP39-202ENST00000409025 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.86■■□□□ 1.09
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USP39-202ENST00000409025 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.82■■□□□ 1.08
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USP39-202ENST00000409025 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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USP39-202ENST00000409025 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 MYH8P13535 1937 aa21.82■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NOVP48745 357 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NDUFA8P51970 172 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PSMD1Q99460 953 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 CABP5Q9NP86 173 aa21.81■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NFIAQ12857 509 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 CCDC125Q86Z20 511 aa21.8■■□□□ 1.08
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