RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405520.5

UBE2C-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 641 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-206ENST00000405520 USP17L22D6RA61 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 USP17L19D6RCP7 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 USP17L20D6RJB6 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 GH2P01242 217 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 HLA-DOAP06340 250 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 PTPREP23469 700 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 RTP1P59025 263 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 ATP2B2Q01814 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 USP17L24Q0WX57 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 C12orf42Q96LP6 360 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 FEZ1Q99689 392 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 SNRKQ9NRH2 765 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 MYH1P12882 1939 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-206ENST00000405520 HOXC6P09630 235 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 GRB14Q14449 540 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 SHHQ15465 462 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CYP2C19P33261 490 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 TRPV1Q8NER1 839 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 USP14P54578 494 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 BTBD7Q9P203 1132 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 VCAM1P19320 739 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 LBX2Q6XYB7 198 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 IGHA2P01877 340 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CYBAP13498 195 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 KBTBD13C9JR72 458 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 IGSF3O75054 1194 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 GNAI2P04899 355 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 MYLIPQ8WY64 445 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-206ENST00000405520 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TRIM60Q495X7 471 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ACER1Q8TDN7 264 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 BADQ92934 168 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 CYP7A1P22680 504 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TNNI3KQ59H18 835 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 DPP9Q86TI2 863 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 EHD4Q9H223 541 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 GPR108Q9NPR9 543 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ZAP70P43403 619 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 USP5P45974 858 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 SNX17Q15036 470 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ANO1Q5XXA6 986 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 MUC3AQ02505 3323 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 SEPT4O43236 478 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 FOSL2P15408 326 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ADORA2AP29274 412 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 CABP5Q9NP86 173 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 STRNO43815 780 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 CERS3Q8IU89 383 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TTC6Q86TZ1 520 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 COBLO75128 1261 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2C-206ENST00000405520 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms