RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 USP17L19D6RCP7 530 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 USP17L20D6RJB6 530 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 HIP1O00291 1037 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 PSMC4P43686 418 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 USP17L24Q0WX57 530 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ACER1Q8TDN7 264 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 RILPL2Q969X0 211 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FEZ1Q99689 392 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 SH2D4AQ9H788 454 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MKNK2Q9HBH9 465 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 TMX2Q9Y320 296 aa13.13□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.12□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 AKR1B1P15121 316 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 SDSP20132 328 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 RASA1P20936 1047 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 RGS19P49795 217 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 LPAR1Q92633 364 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 NAPBQ9H115 298 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.11□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 SMIM22K7EJ46 135 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FCGRTP55899 365 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CAP1Q01518 475 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 PDE4BQ07343 736 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 LBX2Q6XYB7 198 aa13.11□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 TRIM47Q96LD4 638 aa13.11□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FOXP2O15409 715 aa13.1□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CAPN15O75808 1086 aa13.1□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 PDE4AP27815 886 aa13.1□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 HERVK_113P62684 666 aa13.1□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ICA1Q05084 483 aa13.1□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.1□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 ARMC5Q96C12 935 aa13.1□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 SIPA1L1O43166 1804 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FOCADQ5VW36 1801 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 A0A0D9SFI3 127 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FGAP02671 866 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 FGRP09769 529 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 VCAM1P19320 739 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 CTGFP29279 349 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 NT5C2P49902 561 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 COG2Q14746 738 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 TTC22Q5TAA0 569 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 MKL1Q969V6 931 aa13.09□□□□□ -0.31
PDCL-202ENST00000394285 VCPKMTQ9H867 229 aa13.09□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 ZMYM6O95789 1325 aa13.09□□□□□ -0.31
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PDCL-202ENST00000394285 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 IRF5Q13568 498 aa13.08□□□□□ -0.32
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PDCL-202ENST00000394285 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.08□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 COA7Q96BR5 231 aa13.08□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.08□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 MYPNQ86TC9 1320 aa13.08□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 ORC4O43929 436 aa13.07□□□□□ -0.32
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PDCL-202ENST00000394285 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 GOPCQ9HD26 462 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL-202ENST00000394285 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
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