RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 KRT2P35908 639 aa21.48■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 PARP10Q53GL7 1025 aa21.48■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 EPSTI1Q96J88 318 aa21.48■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 KIFC2Q96AC6 838 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 EXOC5O00471 708 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CUL4BQ13620 913 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 SPATA1Q5VX52 437 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 PAGE5Q96GU1 130 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CACNA1SQ13698 1873 aa21.47■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 COL4A1P02462 1669 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CAMTA2O94983 1202 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 NTSR2O95665 410 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 PANX2Q96RD6 677 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 TEX33O43247 280 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 PRDM1O75626 825 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 AFMP43652 599 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 DESI2Q9BSY9 194 aa21.46■■□□□ 1.03
CBX1-202ENST00000393408 FERMT2Q96AC1 680 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 ABCF2Q9UG63 623 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 A0A1B0GUL6 1792 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 WNT7AO00755 349 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PLA2G4AP47712 749 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 DPYDQ12882 1025 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.45■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 RREB1Q92766 1687 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 BMP15O95972 392 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PBX1P40424 430 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 FAM193AP78312 1265 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 MTF1Q14872 753 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 TNFRSF25Q93038 417 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CASP1P29466 404 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 GSDMAQ96QA5 445 aa21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 STRCQ7RTU9 1775 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CCDC175P0C221 793 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 STX17P56962 302 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 TROAPQ12815 778 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 NPY5RQ15761 445 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.43■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 SEMA3EO15041 775 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 GYG1P46976 350 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 RBL2Q08999 1139 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 FGRP09769 529 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 EPC1Q9H2F5 836 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 ATP8B1O43520 1251 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CALM1P0DP23 149 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CALM2P0DP24 149 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CALM3P0DP25 149 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 ZNF174Q15697 407 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.41■■□□□ 1.02
CBX1-202ENST00000393408 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms