RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CFAP45Q9UL16 551 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLIC4Q9Y696 253 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ELP1O95163 1332 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 BTBD18B2RXH4 712 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 NFKBIEO00221 500 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 HLA-DOAP06340 250 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 LIG1P18858 919 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRELPP51888 382 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ANO1Q5XXA6 986 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 BRAPQ7Z569 592 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIM22Q8IYM9 498 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PNMA1Q8ND90 353 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 OXER1Q8TDS5 423 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 WASF1Q92558 559 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP95Q96GE4 821 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAP3K14Q99558 947 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TAOK3Q9H2K8 898 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 DNAJC18Q9H819 358 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PI4KBQ9UBF8 816 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SWAP70Q9UH65 585 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAD2L2Q9UI95 211 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PCDHA7Q9UN72 937 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR7Q9Y216 660 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 BCS1LQ9Y276 419 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 QSER1Q2KHR3 1735 aa5□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SHTN1A0MZ66 631 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLRN2A0PK11 232 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYCE3A1L190 88 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM196BA6NMK8 535 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 USP17L5A8MUK1 530 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADAMTS3O15072 1205 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CYTH3O43739 400 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 ENTPD3O75355 529 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MMP1P03956 469 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SPDYE6P0CI01 402 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF5BP33176 963 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 GNAQP50148 359 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 JAG1P78504 1218 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIM29Q14134 588 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC39A14Q15043 492 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PTPAQ15257 358 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 DLGAP5Q15398 846 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 NPY5RQ15761 445 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC17Q96LX7 622 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 RBSNQ9H1K0 784 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 EHD4Q9H223 541 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CPVLQ9H3G5 476 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 STX8Q9UNK0 236 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD66.1-201ENST00000391230 COL4A5P29400 1685 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms