RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 CCL5P13501 91 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 UBXN2AP68543 259 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 SWAP70Q9UH65 585 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 PLXNB2O15031 1838 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L12C9JPN9 530 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L21D6R901 530 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 USP14P54578 494 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 C12orf60Q5U649 245 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 ERC2O15083 957 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L15C9J2P7 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L11C9JVI0 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L18D6R9N7 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L22D6RA61 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L19D6RCP7 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L20D6RJB6 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L24Q0WX57 530 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 Q3C1V9 767 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 SHISA4Q96DD7 197 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 RNF208Q9H0X6 261 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GJD2Q9UKL4 321 aa28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PRG0 241 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 INHAP05111 366 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 VCAM1P19320 739 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 OSBP2Q969R2 916 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GJB1P08034 283 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 AKR1B1P15121 316 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 CDK8P49336 464 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 ERVK-9P63128 1117 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 ERVK-24P63145 666 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 CTR9Q6PD62 1173 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 APPBP2Q92624 585 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GJA8P48165 433 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 PORCNQ9H237 461 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-201ENST00000378543 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 CNMDO75829 334 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 MX1P20591 662 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC17Q96LX7 622 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 M0R2C6 588 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 GPAA1O43292 621 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 MAPK4P31152 587 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2B6P20813 491 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 ICA1Q05084 483 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SBK1Q52WX2 424 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 RLFQ13129 1914 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 LBX2Q6XYB7 198 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 GPR142Q7Z601 462 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SMC5Q8IY18 1101 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 BTBD7Q9P203 1132 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SGPL1O95470 568 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 HMGCRP04035 888 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 FSD1Q9BTV5 496 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms